武漢大學檔案館成立于1988年7月，是保存和提供利用學校檔案的直屬單位，也是學校校史館和周恩來舊居的管理服務部門。截至2021年底，檔案館館藏全部檔案503766卷、41852件（含財務檔案室檔案），分為國立武漢大學、私立文華圖書館學專科學校、武漢大學、武漢水利電力大學、武漢測繪科技大學、湖北省立醫學院、湖北醫科大學、武漢大學（新）8個全宗。